アトピー性皮膚炎も、円形脱毛症と関係が深いと考えられています。実際、アトピーを患っている人と、そうではない人の円形脱毛症罹患率を比較した場合、アトピーを患っている人の方が円形脱毛症を発症している割合が多いのだそうです。このアトピーも、免疫機能の異常が原因とされているわけですが、自己免疫疾患と同様の理由で円形脱毛症が発症するのではないか、と推測されています。